1、冷藏或冷凍保存。在水質分析儀檢測前，冷藏或冷凍的作用是抑制微生物活動，減緩物理揮發和化學反應的速度。但該方法受溫度、時間和水污染濃度影響較大，因此不宜存放超過12小時。

　　2、添加化學試劑保存

　　(1)加入生物抑制劑：如果在水樣中加入hgci2測定氨氮、硝酸鹽氮和化學需氧量(COD)，可抑制生物氧化還原；用于苯酚測定的水樣，用H3PO4調節pH至4，并加入適量的CuSO4，可抑制苯酚菌的分解活性。

　　(2)調節pH值：在水質分析儀測試前，用hn03溶液將酸化至pH值1-2的水樣進行金屬離子的測定，不僅可以防止重金屬離子的水解和沉淀，還能防止重金屬離子的水解和沉淀。防止容器壁吸附金屬；向水樣中加入NaOH溶液用于測定氰化物或揮發性酚類，調節pH至12，形成穩定的酚鹽。

　　（3）加入氧化劑或還原劑：如水樣中應加入HNO3（pH<1）和K2Cr2O7（0.5g/L）測定汞，以保持汞的高價態。應在水樣中加入抗壞血酸測定硫化物，防止硫化物被氧化；應在水樣中加入少量的MnSO4溶液和Ki溶液測定溶解氧，以固定（減少）溶解氧。